生物安全柜是實驗室生物安全的安全隔離屏障，也是實驗室為關鍵的安全防護設備。是防止操作過程中含有危險性生物氣溶膠散逸負壓空氣凈化排風柜，生物安全柜主要和關鍵的部件是空氣過濾器（HEPA）。是用于各類生物安全實驗室從事實驗診斷和原代培養物、菌毒株及其他檢測樣本等具有感染性的生物材料的操作，具有保護操作者、實驗環境以及實驗樣品的安全防護設備。設備在使用時，做好其安全防護工作是重要的。那么該怎樣做好生物安全柜的安全防護工作呢？
一、避免將塑料制品或塑料涂布材料直接裸露在UV射線下，千萬不要取消安全柜內部安全連鎖裝置及在UV燈打開狀態下進行操作。
二、HEPA過濾器只對顆粒物質起過濾作用。如果操作中會產生一些有害氣體或蒸汽，例如：有毒的化學品或放射性物質就需要小心的估算其可能對安全柜造成的污染和危害水平，要按照適當的規則進行操作。
三、當出現下列情況時對安全柜進行消毒
1、需要進入到被污染區域進行性能保養之前。
2、換HEPA之前。
3、需要進入到被污染區域進行性能測試之前。
4、移動安全柜之前。
5、改變了研究課題。
6、生物性危害物質溢出后。
四、HEPA過濾器會逐漸積累上很多空氣中以及安全柜工作區域中的灰塵顆粒，積累的速率主要依據空氣的潔凈度和安全柜工作時間以及在安全柜內所要做的工作性質。顯示器將顯示過濾器壽命。
五、安全柜要避免使用可燃性氣體或溶劑，確需使用的話，要密切注意可燃性氣體或性氣體及其蒸汽的濃度。
六、當對安全柜表面進行滅菌時
1、避免消毒液濺到手上或皮膚上。
2、要有良好的通風。
3、進行滅菌工作時，要嚴格遵照消毒液制造商的安全指南，并根據本地政府或的法律排放消毒液。
4、不要讓含有高濃度游離態氯氣的消毒液長時間接觸安全柜內的不銹鋼部件，因為長時間的接觸游離態氯氣會腐蝕不銹鋼表面。
七、確保安全柜的工作電源與當地使用的電源相同。電源使用不當會引起火災或電擊，在維修或拆除電路元器件時，要先將安全柜電源拔下。
八、安全柜內謹慎使用明火。因為明火會干擾安全柜內氣流流動方式，點燃HEPA過濾器和損壞過濾器的周邊設施。安全柜內不要使用高壓氣體，因為高壓氣體同樣也會干擾柜內氣流流動方式。
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